我国科研人员开发检验基因表达“开关”可靠性的数据库

  新华社南京12月3日电（记者陈席元）RNA甲基化修饰被认为是控制基因表达的“开关”，但长期以来，该领域研究中有关基因位点是否有修饰的实验结果并不稳定。

  记者3日从位于江苏苏州的西交利物浦大学获悉，该校助理教授魏震团队综合近1400种研究数据，开发可交叉验证的RNA甲基化修饰位点数据库，为今后评价相关实验结论是否可靠提供参考。研究成果3日发表在国际学术期刊《核酸研究》上，并向全球免费开放。

  魏震介绍，RNA甲基化修饰能控制基因的表达，被认为与多种疾病密切相关，也是近年来国内外生物学研究的热点。

  然而，该领域长期面临一大难题，同一个基因、同一处位点，采用不同的检测方法，会得到大相径庭的检测结果。

  “这篇论文认为某位点有修饰，那篇论文认为没有修饰，令后来的研究者无所适从，只能重新测一遍，造成重复劳动和资源浪费。”魏震说。

  团队想到，可以用统计学方法回顾已有研究，检验各类实验结果的可靠性。

  魏震告诉记者，过去两年里，团队重点收集了东亚、北美、欧洲三大公共数据库1393个生物学样本的原始测序数据，覆盖了10种常用的RNA甲基化修饰检测技术。

  通过“正交验证”算法，团队识别出13.5万个高置信度RNA甲基化修饰位点，建成标准统一、直接可比的数据库，目前已有24个国家的科研人员使用。

  “这个数据库将帮助科研人员区分实验中出现的信号，哪些是可靠的生物学标记，哪些只是实验噪音。”魏震表示，研究中团队还发现6000多个基因变异，其中有些变异与抑郁症等复杂疾病的RNA甲基化修饰位点呈现高度相关性，有望为科学家探究疾病的分子机制提供新角度。